胡波教授团队发表肝癌预后评估重要学术成果

发布人:检验科 发布日期:2021-09-03

    近日,新葡亰8883ent检验科主任胡波教授团队与感染性疾病科崇雨田教授团队、生物治疗中心张琪教授团队在数学与计算生物学领域高水平杂志Briefings in Bioinformatics (2021 IF: 8.9)发表了题目为“HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues”的原创性成果。龚娇、李荣为论文的共同第一作者,胡波、崇雨田、张琪教授为论文的共同通讯作者。

 

 

 

    肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是严重威胁人类健康的恶性肿瘤,其发病率在各类肿瘤中居于第五,死亡率居于第三。我国是HCC的高发区,每年约有40万新增病例,约占全球总新发病例的 40%。近年来,胡波教授团队一直从事肝脏疾病相关研究,致力于筛选出新的检验指标,更好地辅助疾病的诊断及预后的评估,为临床提供支持。目前,HCC患者的预后评估主要基于肿瘤本身的性状,而癌旁组织在预后中的作用尚不明确。

本研究首次发现,HCC和癌旁组织中免疫和标志基因集的活性变化可以用于HCC患者的分型,且不同分型与患者的预后密切相关。亚型1的患者预后显著好于亚型2和亚型3。研究还进一步筛选并验证了与预后紧密相关的3个肿瘤基因集、4个癌旁基因集。功能富集分析发现,4个癌旁基因集中的基因与免疫反应、细胞粘附等信号通路密切相关,可能影响转移和复发,提示免疫治疗时应考虑癌旁组织的性状;而3个肿瘤基因集中的基因则与细胞周期等通路密切相关,这与之前的研究一致。总的来说,本研究首次在HCC领域综合癌旁和癌组织的基因集的富集分数,对患者进行分型及预后评估,为HCC的治疗提供了新的思路——在选择HCC治疗方式时,应该综合考虑癌旁及癌组织的变化。

 

 

3个HCC亚型的代表性的免疫和标志基因集的热图

 

参考文献:

Gong J, Li R, Chen Y, Zhuo Z, Chen S, Cao J, Zhang Q, Chong Y, Hu B. HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues. Brief Bioinform. 2021 Jan 30:bbaa427. doi: 10.1093/bib/bbaa427. Epub ahead of print. PMID: 33515024.